El módulo de formación profesionalizante de Sanidad animal tiene 15 créditos académicos de carácter optativo que equivalen a 675 horas totales. Se impartirá de manera mixta durante el segundo y tercer semestre. El doctorando durante este periodo de formación podrá elegir entre los siguientes cursos: Técnicas de Diagnóstico avanzadas, Enfermedades infecciosas y zoonóticas, Enfermedades parasitarias y zoonóticas, Sistema de Inocuidad alimentaria, Enfermedades de Organismos acuáticos, Enfermedades toxínicas, metabólicas y carenciales, Epidemiologia Avanzada.
Enfocarse en la investigación de enfermedades prevalentes en la ganadería nicaragüense, desarrollar estrategias de prevención y control efectivas, estudiar la resistencia a antibióticos y promover prácticas de salud animal que minimicen el uso de medicamentos, además de explorar la relación entre la salud animal y la salud pública.